Deoksi nukleotidai deoksi nukleozidų kurie sudaryti iš ir cukraus fosfatai Iš jų net tik sudaromi biopolimerai DNR ir RN

(Deoksi)nukleotidai – (deoksi)nukleozidų, kurie sudaryti iš ir cukraus, fosfatai. Iš jų net tik sudaromi biopolimerai DNR ir RNR, bet jie įeina ir į kai kurių kofaktorių (, NADP, KoA, , FMN) sudėtį. Nukleotidai atlieka svarbų vaidmenį ląstelės metabolizme, signalo perdavime.

Nukleotidas – monomeras, sudarantis biopolimerą DNR.

Nomenklatūra

Nukleotidų pavadinimai sudaromi iš keturių raidžių.

Pirmoji (mažoji) nurodo ar nukleotidas yra ribonukleotidas, ar deoksiribonukleotidas. Ribonukleotido atveju pirmoji raidė nerašoma, o deoksiribonukleotido atveju rašoma d.
Antroji (didžioji) raidė nurodo kokia heterociklinė bazė įeina į nukleotido sudėtį:

G: Guaninas

A: Adeninas

T: Timinas paprastai aptinkamas DNR sudėtyje

C: Citozinas

U: Uracilas paprastai aptinkamas RNR sudėtyje

Trečioji (didžioji) raidė nurodo kiek fosforo rūgšties liekanų yra nukleotido sudėtyje: viena (M; Mono-), dvi (D; Di-), trys (T; Tri-).
Ketvirtoji raidė P nurodo, kad sudėtyje yra fosforo rūgšties liekanų.

Pavyzdžiui, deoksi citidin tri fosfatas sutrumpintai žymimas dCTP.

(Deoksi)nukleotidų struktūra

Jei fosforo rūgšties liekana jungiasi prie , turime , jei prie – deoksiribonukleotidus. Pirmieji yra RNR monomerai, antrieji – DNR monomerai. Jei fosforo rūgšties liekana jungiasi prie adenozino 5'-hidroksilo grupės, turime , jei prie uridino 2'-hidroksilo grupės – turime , jei prie deoksitimidino 3'-hidroksilo grupės – .

Nukleotidai

AMP	Adenozindifosfatas ADP	Adenozintrifosfatas ATP
GMP	GDP	GTP
TMP	TDP	TTP
UMP	UDP	UTP
CMP	CDP	CTP

Deoksinukleotidai

dAMP	dADP	dATP
dGMP	dGDP	dGTP
dTMP	dTDP	dTTP
dUMP	dUDP	dUTP
dCMP	dCDP	dCTP

Nukleotidų gavimas

Iš nukleotidų sudarytos nukleino rūgštys, tad nukleotidai paprastai gaunami jas hidrolizuojant. Hidrolizuojant RNR šarmais gaunama ir mišinys. Paveikus DNR arba RNR įvairiais fermentais, susidaro ir . Nukleino rūgščių hidrolizės produktai rodo, kas rūgšties liekana nukleotiduose gali jungtis prie nukleozidų 2'-hidroksilo, 3'-hidroksilo arba 5'-hidroksilo grupių.

Nukleotidų funkcijos

Nukleotidai įeina ne tik į nukleino rūgščių, bet ir į nukleotidinių kofermentų

(NAD+),
jo fosforilinto analogo NADP+,
(FAD),
flavinmononukleotido (FMN),
kofermento A (KoA) ir kt. sudėtį.

Organizme būna ir laisvų nukleotidų. Nukleotidais vadinami ir ir trifosfatai. Šie polifosfatai yra labai svarbūs ląstelės bioenergetikai, ypač adenozin-5'-trifosfatas (ATP). Nukleozid-5'-trifosfatai yra nukleino rūgščių substratai. Labai svarbūs yra ir , ypač adenozin-3',5'-ciklofosfatas, kuris yra daugelio hormonų veikimo tarpininkas.

Šaltiniai

Juodka Benediktas (1989). Nukleino rūgščių, chemijos ir biochemijos pagrindai. Vilnius, „Mokslas“, 1989, 271p.

Vikiteka: Nukleotidas – vaizdinė ir garsinė medžiaga

[1] Juodka Benediktas (1989). Nukleino rūgščių, chemijos ir biochemijos pagrindai. Vilnius, „Mokslas“, 1989, 271p.